報告題目:RNA幹擾過程的數學建模、逃逸問題、周期性和劑量優化問題研究
報告時間:2021年5月9日(星期日)上午8:30-9:30
報告地點:必一体育平台二樓會議室
報告摘要:RNA 幹擾(RNA interference,RNAi)是一種通常由雙鏈 RNA (dsRNA)分子引起的特異性轉錄後基因沉默現象,這項發現於 2006 年獲得諾貝爾生理學獎。RNAi 技術已廣泛應用於昆蟲基因功能研究、害蟲防治、殺蟲劑靶基因的篩選和鑒定等領域。本報告首先根據 RNAi 效應階段的生物化學反應特點,以飛蝗幾丁質酶基因幹擾為例,用Bayes方法和MCMC方法研究 dsRNA 逃逸量的計算問題。接著以真核細胞中 RNA 幹擾為例,考慮時滯效應的Hill反應,建立了mRNA與蛋白質的關系模型,研究了mRNA與蛋白質的演變規律、siRNA劑量和結合位點數與周期性震蕩的關系、周期的計算及對參數敏感性,最後研究了siRNA劑量的優化問題。本研究可以為RNA技術的應用提供理論指導。
裴永珍教授簡介:教授,博士生導師,中國數學會生物數學專委會常務委員、天津市工業與應用數學學會副理事長。主要從事混雜動力系統的優化與控製、數據處理和分析研究,機發展了切換系統的梯度計算、參數和控製變量優化及統計推斷等方法,在基因調控和生物控製等領域取得一系列成果。發表論文100余篇,被SCI檢索80篇。主持國家自然科學基金3項,參加國家自然科學基金2項,參加完成市級項目3項,主持完成橫向課題3項。天津市優秀碩士學位論文指導獎,天津市教學名師、入選“天津市高校學科領軍人才培養計劃”。研究方向為動力系統、機器學習、生物信息、數據分析、優化與控製、混雜系統的最優控製、最優化計算方法。